Como mencionamos anteriormente, el listado de los mejores colegios, tomando en cuenta la calidad educativa de los planteles, así como la de los docentes que se desempeñen en ellos, no solo se realiza en la provincia de Lima, sino que, por contrario, este listado es realizado en las principales provincias del país. Para su creación, además se toma en cuenta el rendimiento académico de los alumnos que hayan egresado de estos centros educativos, y así asegurar un puesto en las principales universidades del Perú.
Los mejores colegios de Arequipa son:
- Independencia Americana
- Honorio Delgado Espinoza
- San Juan Bautista de la Salle
- Salesianos Don Bosco
- Colegio Peruano Alemán Max Uhle
- Colegio Anglo Americano Prescott
- Colegio San José
- Colegio Sagrados Corazones
- Colegio Internacional Peruano Británico
- Sagrado Corazón (Sophianum)